万方论文查重与引用识别技术的原理主要包括两部分：查重技术和引用识别技术。查重技术通过比对论文文本内容，识别相似度高的部分，判断是否存在抄袭行为；引用识别技术则是通过分析文献引用关系，确定文献之间的引用关系，帮助学术研究者了解文献间的关联性。

在万方论文查重与引用识别技术中，查重技术通常采用文本相似度计算算法，如余弦相似度算法等，来比对论文文本内容，判断是否存在抄袭行为。而引用识别技术则依靠文献引用关系的分析，通过构建引文网络等方式，识别文献之间的引用关系，帮助学术研究者了解文献的学术价值和影响力。